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Il Museo Naturalistico del Parco Regionale di Colfiorito ospita una mostra permanente di pannelli, diorami, scatole entomologiche e riproduzioni tridimensionali del paesaggio.
Il settore avifauna è stato arricchito dalla collezione Piscini (tassidermista della provincia di Macerata) con i suoi 52 esemplari di avifauna imbalsamati rappresentanti le specie più significative della palude e degli ambienti circostanti, tra cui un esemplare di particolare pregio di Tarabuso (Botaurus stellaris) specie simbolo del Parco.
Il museo ha prevalentemente finalità didattiche, svolge un'importante funzione di integrazione tra uomo e ambiente naturale mediante la promozione di attività di educazione, di sensibilizzazione e di ricerca scientifica. E' presente, inoltre, un'aula multimediale adatta a proiezioni, conferenze e un laboratorio didattico, munito di microscopi dove è custodito un erbario completo della flora del parco, organizzato per accogliere studenti e semplici appassionati di scienze naturali.