| Gargano | 121.118 ha |
| Bosco Incoronata | 1.060 ha | ||
| Fiume Ofanto | 24.883 ha |
| Isole Tremiti | 1.466 ha |
| Falascone | 48 ha | ||
| Foresta Umbra | 399 ha | ||
| Il Monte | 130 ha | ||
| Ischitella e Carpino | 299 ha | ||
| Isola di Varano | 145 ha | ||
| Lago di Lesina (parte orientale) | 930 ha | ||
| Masseria Combattenti | 82 ha | ||
| Monte Barone | 124 ha | ||
| Palude di Frattarolo | 257 ha | ||
| Saline di Margherita di Savoia | 3.871 ha | ||
| Sfilzi | 56 ha |
| Lago Salso (Oasi Affiliata WWF) | 540 ha |