RomaNatura gestisce il sistema dell'Aree Naturali protette situate interamente all'interno del Comune di Roma.
Il sistema comprende 9 Riserve Naturali "costituite da aree terrestri, fluviali, lacuali che contengono una o più specie naturalisticamente rilevanti della flora e della fauna, ovvero presentino uno o più ecosistemi importanti per le diversità biologiche o per la conservazione delle risorse genetiche" (articolo 5 L.R. n. 29/97) istituite con L.R. n. 29/97:
2 Parchi Regionali precedenti all'istituzione di RomaNatura:
2 Monumenti Naturali "habitat o ambienti di limitata estensione, esemplari vetusti di piante, formazioni geologiche o paleontologiche che presentano caratteristiche di rilevante interesse naturalistico e/o scientifico." (articolo 6 legge regionale n. 29 del 97):
1 Area Marina Protetta istituita con Decreto del Ministero dell'Ambiente del 29 novembre 2000: