| | Cinque Terre | 4.591 ha |
| | Isole Tremiti | 1.466 ha |
| | Baia | 177 ha |
| | Capo Caccia - Isola Piana | 2.631 ha |
| | Capo Carbonara | 14.360 ha |
| | Capo Gallo - Isola delle Femmine | 2.173 ha |
| | Capo Milazzo | 754 ha |
| | Capo Rizzuto | 14.721 ha |
| | Capo Testa - Punta Falcone | 5.160 ha |
| | Costa degli Infreschi e della Masseta | 2.332 ha |
| | Gaiola | 42 ha |
| | Isola dell'Asinara | 10.732 ha |
| | Isola di Bergeggi | 215 ha |
| | Isola di Ustica | 15.951 ha |
| | Isole Ciclopi | 628 ha |
| | Isole di Ventotene e Santo Stefano | 2.799 ha |
| | Isole Egadi | 53.992 ha |
| | Isole Pelagie | 4.136 ha |
| | Miramare | 30 ha |
| | Penisola del Sinis - Isola Mal di Ventre | 25.673 ha |
| | Plemmirio | 2.429 ha |
| | Porto Cesareo | 16.654 ha |
| | Portofino | 346 ha |
| | Punta Campanella | 1.539 ha |
| | Regno di Nettuno | 11.256 ha |
| | Santa Maria di Castellabate | 7.095 ha |
| | Santuario per i Mammiferi Marini | 2.557.258 ha |
| | Secche della Meloria | 9.372 ha |
| | Secche di Tor Paterno | 1.387 ha |
| | Tavolara - Punta Coda Cavallo | 15.357 ha |
| | Torre del Cerrano | 3.431 ha |
| | Torre Guaceto | 2.227 ha |