| | Biotopo Lago di Caldaro - Kalterer See | 241 ha |
| | Cassa di espansione del fiume Secchia | 255 ha |
| | Foce del fiume Platani | 207 ha |
| | Foce dell'Isonzo | 1.154 ha |
| | Foce Sele e Tanagro | 7.284 ha |
| | Foci dello Stella | 1.377 ha |
| | Fondo Toce | 361 ha |
| | Gardesana orientale | 219 ha |
| | Isola Boschina | 38 ha |
| | Isolotto del Ritano | 253 ha |
| | Laghi di Doberdò e Pietrarossa | 727 ha |
| | Lago di Cornino | 487 ha |
| | Lago di Montorfano | 89 ha |
| | Lago di Penne (Oasi Affiliata WWF) | 150 ha |
| | Lago di Pergusa | 403 ha |
| | Lago di Santa Luce | 278 ha |
| | Lago Falciano | 95 ha |
| | Pian di Spagna e Lago di Mezzola | 1.586 ha |
| | Sorgenti del Belbo | 466 ha |
| | Sorgenti del Pescara | 49 ha |
| | Tevere Farfa | 705 ha |
| | Torrente Orba | 258 ha |
| | Val Sarmassa | 231 ha |
| | Valle Andona, Valle Botto e Valle Grande | 928 ha |
| | Valle dell'Aniene (dentro il GRA) | 650 ha |