| | | Abbazia Acqualunga | 90 ha |
| | | Adda Morta - Lanca della Rotta | 115 ha |
| | | Boschetto della Cascina Campagna | 2 ha |
| | | Boschetto di Scaldasole | 76 ha |
| | | Boschi del Giovetto di Palline | 675 ha |
| | | Bosco dei Bordighi | 40 ha |
| | | Bosco dell'lsola | 42 ha |
| | | Bosco della Marisca | 25 ha |
| | | Bosco di Barco | 30 ha |
| | | Bosco Ronchetti | 28 ha |
| | | Complesso Morenico di Castellaro Lagusello | 209 ha |
| | | Fontana del Guercio | 28 ha |
| | | Fontanile Brancaleone | 10 ha |
| | | Fontanile Nuovo | 39 ha |
| | | Garzaia del Bosco Basso | 7 ha |
| | | Garzaia della Carola | 33 ha |
| | | Garzaia della Cascina Isola | 11 ha |
| | | Garzaia della Roggia Torbida | 8 ha |
| | | Garzaia di Pomponesco | 62 ha |
| | | Garzaia di Porta Chiossa | 80 ha |
| | | Garzaia di Villa Biscossi | 16 ha |
 | | Incisioni Rupestri di Ceto, Cimbergo e Paspardo | 290 ha |
 | | Isola Boschina | 38 ha |
 | | Isola Boscone | 200 ha |
| | | Isola Uccellanda | 60 ha |
| | | Lago di Biandronno | 128 ha |
| | | Lago di Ganna | 70 ha |
| | | Lago di Montorfano | 89 ha |
| | | Lago di Piano | 176 ha |
| | | Lago di Sartirana | 24 ha |
| | | Lanca di Gabbioneta | 9 ha |
| | | Lanca di Gerole | 48 ha |
| | | Lanche di Azzanello | 22 ha |
| | | Le Bine | 96 ha |
| | | Marmitte dei Giganti | 38 ha |
| | | Monte Alpe | 328 ha |
| | | Monticchie | 43 ha |
| | | Naviglio della Melotta | 181 ha |
| | | Oasi WWF Bosco di Vanzago | 200 ha |
| | | Oasi WWF Valpredina | 90 ha |
| | | Palata di Menasciutto | 11 ha |
| | | Paluaccio di Oga | 30 ha |
| | | Palude Brabbia | 459 ha |
 | | Palude di Ostiglia | 123 ha |
| | | Palude Loja | 16 ha |
 | | Pian di Spagna e Lago di Mezzola | 1.586 ha |
| | | Pian Gembro | 127 ha |
| | | Piramidi di Postalesio | 6 ha |
| | | Piramidi di Zone | 21 ha |
| | | Riva orientale del Lago di Alserio | 82 ha |
| | | Sasso Malascarpa | 137 ha |
| | | Sorgente Funtaní | 66 ha |
| | | Sorgenti della Muzzetta | 86 ha |
| | | Stagni di Lungavilla | 76 ha |
| | | Torbiere del Sebino d'Iseo | 325 ha |
| | | Torbiere di Marcaria | 52 ha |
| | | Val di Mello | 6.000 ha |
| | | Vallazza | 538 ha |
| | | Valle Bova | 391 ha |
| | | Valle del Freddo | 70 ha |
| | | Valle del Prato della Noce | 902 ha |
| | | Valli del Mincio | 1.426 ha |
| | | Valli di Bondo | 77 ha |
| | | Valli di Sant'Antonio | 239 ha |
| | | Valsolda | 318 ha |