| | | Alto Martesana | 298 ha |
| | | Alto Milanese | 360 ha |
| | | Alto Sebino | 6.708 ha |
| | | Ariadello e Valle dei Navigli | 34 ha |
| | | Balossa | 146 ha |
| | | Barberino | 119 ha |
| | | Basso Chiese | 215 ha |
| | | Basso Corso del Fiume Brembo | 974 ha |
| | | Basso Mella | 221 ha |
| | | Bosca | 74 ha |
| | | Bosco del Rugareto | 1.260 ha |
| | | Brembiolo | 546 ha |
| | | Brembo e Cantoni di Lenna | 200 ha |
| | | Brianza Centrale | 396 ha |
| | | Brughiera Briantea | 2.600 ha |
| | | Cascine di Pioltello | 213 ha |
| | | Castello dal Verme | 46 ha |
| | | Castello di Verde | 40 ha |
| | | Castiglione delle Stiviere | 1.179 ha |
| | | Cavallera | 625 ha |
| | | Colli Briantei | 550 ha |
| | | Collina di San Colombano | 716 ha |
| | | Colline di Brescia | 4.001 ha |
| | | Corno di Predore e Tavernola | 376 ha |
| | | Corridoio Morenico del Basso Garda Bresciano | 514 ha |
| | | Dei Fontanili e dei Boschi | 150 ha |
| | | Dei Mulini | 501 ha |
| | | Del Gelso | 980 ha |
| | | Della Rocca e del Sasso | 90 ha |
| | | Est delle Cave | 573 ha |
| | | Fiume Tormo | 4.406 ha |
| | | Fontanile San Giacomo | 413 ha |
| | | Fontanili di Capralba | 745 ha |
| | | Fortunago | 400 ha |
| | | Geradadda | 3.001 ha |
| | | Golena del Po | 600 ha |
 | | Golenale del Gruccione | 388 ha |
| | | Golenale lungo il Po | 1.728 ha |
 | | Golene Foce Secchia | 1.200 ha |
| | | Grugnotorto - Villoresi | 830 ha |
| | | Incisioni Rupestri di Grosio | 26 ha |
| | | La Golena e le sue Lanche | 1.439 ha |
| | | La Valletta | 509 ha |
| | | Lago del Segrino | 300 ha |
| | | Lago di Endine | 1.606 ha |
| | | Lago Moro | 131 ha |
| | | Lambro Meridionale e del Ticinello | 616 ha |
| | | Le Folaghe | 72 ha |
| | | Malmera, Montecchi e Colle degli Angeli | 975 ha |
| | | Media Valle del Lambro | 296 ha |
| | | Medio Olona | 613 ha |
| | | Molgora | 1.000 ha |
| | | Monte Canto e del Bedesco | 2.969 ha |
| | | Monte Lesima | 1.250 ha |
| | | Monte Varro | 2.423 ha |
| | | Moso | 1.058 ha |
| | | NaturalSerio | 248 ha |
| | | Palustre | 60 ha |
 | | Parco San Lorenzo | 29 ha |
| | | Pianalto di Romanengo e Navigli Cremonesi | 1.211 ha |
| | | Piazzo | 75 ha |
| | | Po e Morbasco | 500 ha |
| | | Primo Maggio | 4 ha |
| | | Rile Tenore Olona | 1.452 ha |
| | | Rio Morla e delle Rogge | 1.687 ha |
| | | Rio Vallone | 616 ha |
| | | Roccolo | 1.595 ha |
| | | Roggie | 513 ha |
| | | Ronchi | 61 ha |
 | | San Colombano | 730 ha |
| | | San Pietro al Monte e San Tomaso | 1.119 ha |
| | | Serio Nord | 158 ha |
| | | Solferino | 240 ha |
| | | Sorgenti del Torrente Lura | 1.228 ha |
| | | Strone | 735 ha |
| | | Val Sanagra | 758 ha |
| | | Valentino | 110 ha |
| | | Valle Albano | 652 ha |
| | | Valle del Lambro | 795 ha |
| | | Valle del Lanza | 554 ha |
| | | Valle del Serio Morto | 851 ha |
 | | Valle del Torrente Lura | 1.500 ha |
| | | Valle San Martino | 694 ha |
| | | Valli d'Argon | 549 ha |
| | | Valpometto | 327 ha |
| | | Abbazia Acqualunga | 90 ha |
| | | Adda Morta - Lanca della Rotta | 115 ha |
| | | Boschetto della Cascina Campagna | 2 ha |
| | | Boschetto di Scaldasole | 76 ha |
| | | Boschi del Giovetto di Palline | 675 ha |
| | | Bosco dei Bordighi | 40 ha |
| | | Bosco dell'lsola | 42 ha |
| | | Bosco della Marisca | 25 ha |
| | | Bosco di Barco | 30 ha |
| | | Bosco Ronchetti | 28 ha |
| | | Complesso Morenico di Castellaro Lagusello | 209 ha |
| | | Fontana del Guercio | 28 ha |
| | | Fontanile Brancaleone | 10 ha |
| | | Fontanile Nuovo | 39 ha |
| | | Garzaia del Bosco Basso | 7 ha |
| | | Garzaia della Carola | 33 ha |
| | | Garzaia della Cascina Isola | 11 ha |
| | | Garzaia della Roggia Torbida | 8 ha |
| | | Garzaia di Pomponesco | 62 ha |
| | | Garzaia di Porta Chiossa | 80 ha |
| | | Garzaia di Villa Biscossi | 16 ha |
 | | Incisioni Rupestri di Ceto, Cimbergo e Paspardo | 290 ha |
 | | Isola Boschina | 38 ha |
 | | Isola Boscone | 200 ha |
| | | Isola Uccellanda | 60 ha |
| | | Lago di Biandronno | 128 ha |
| | | Lago di Ganna | 70 ha |
| | | Lago di Montorfano | 89 ha |
| | | Lago di Piano | 176 ha |
| | | Lago di Sartirana | 24 ha |
| | | Lanca di Gabbioneta | 9 ha |
| | | Lanca di Gerole | 48 ha |
| | | Lanche di Azzanello | 22 ha |
| | | Le Bine | 96 ha |
| | | Marmitte dei Giganti | 38 ha |
| | | Monte Alpe | 328 ha |
| | | Monticchie | 43 ha |
| | | Naviglio della Melotta | 181 ha |
| | | Oasi WWF Bosco di Vanzago | 200 ha |
| | | Oasi WWF Valpredina | 90 ha |
| | | Palata di Menasciutto | 11 ha |
| | | Paluaccio di Oga | 30 ha |
| | | Palude Brabbia | 459 ha |
 | | Palude di Ostiglia | 123 ha |
| | | Palude Loja | 16 ha |
| | | Pian di Spagna e Lago di Mezzola | 1.586 ha |
| | | Pian Gembro | 127 ha |
| | | Piramidi di Postalesio | 6 ha |
| | | Piramidi di Zone | 21 ha |
| | | Riva orientale del Lago di Alserio | 82 ha |
| | | Sasso Malascarpa | 137 ha |
| | | Sorgente Funtaní | 66 ha |
| | | Sorgenti della Muzzetta | 86 ha |
| | | Stagni di Lungavilla | 76 ha |
| | | Torbiere del Sebino d'Iseo | 325 ha |
| | | Torbiere di Marcaria | 52 ha |
| | | Val di Mello | 6.000 ha |
| | | Vallazza | 538 ha |
| | | Valle Bova | 391 ha |
| | | Valle del Freddo | 70 ha |
| | | Valle del Prato della Noce | 902 ha |
| | | Valli del Mincio | 1.426 ha |
| | | Valli di Bondo | 77 ha |
| | | Valli di Sant'Antonio | 239 ha |
| | | Valsolda | 318 ha |