Il Parco è distribuito sul territorio di 13 comuni della provincia del Verbano Cusio Ossola: Aurano, Beura-Cardezza, Caprezzo, Cossogno, Intragna, Malesco, Miazzina, Premosello Chiovenda, San Bernardino Verbano, Santa Maria Maggiore, Trontano, Valle Cannobina, Vogogna, i cui capoluoghi si trovano tutti all'esterno dei confini. All'interno ci sono solo tre frazioni (Cicogna in comune di Cossogno, Colloro in comune di Premosello Chiovenda e Genestredo in territorio di Vogogna) e parte del centro storico di Vogogna.
I paesi sono situati in 4 distinte valli: la Valle Intrasca, la Val Cannobina, la Valle Ossola e la Val Vigezzo, riunite in due comunità montane, quella del Verbano le prime due e quella delle Valli Ossolane le altre.